中國機構(gòu)出援手對EHEC進行測序和基因組分析

5月中旬，一種被稱為EHEC(腸出血性大腸桿菌)耐*****導(dǎo)致的疫情在德國北部集中暴發(fā)。

在過去一周內(nèi)，共發(fā)現(xiàn)1000多例EHEC確診或疑似病例，遍布德國16個州中的15個州，目前已證實有10人死亡。

EHEC疫情蔓延

5月15日，德國下薩克森州一位83歲老婦被發(fā)現(xiàn)有嚴重腸出血癥狀后，被緊急送往醫(yī)院。21日，她在醫(yī)院死去。不久之后，德國衛(wèi)生部門證實，這位老婦被EHEC中的一種亞型感染。

情況還在惡化。5月24日早些時候，Bremen的一位年輕婦女也因感染EHEC在當(dāng)?shù)蒯t(yī)院死亡;還有一位感染EHEC的婦女死亡原因尚不明朗。

不僅如此，目前感染EHEC的患者中，有40名重度患者情況不容樂觀，他們不同程度地出現(xiàn)了腸出血、腹水和腎功能衰竭癥狀。

更可怕的是，此次流行的EHEC亞型是經(jīng)過變異的耐*****，疑似超級**。

 “當(dāng)前的疫情超過了任何一次歷**的狀況，EHEC從沒有在德國如此集中暴發(fā)。”來自基爾市石勒蘇益格—荷爾施泰因(Schleswig-Holstein)醫(yī)學(xué)院的生物學(xué)家Werner Solbach說。

事實上，德國每年大約有1000人感染此類**。然而*近一星期的感染人數(shù)，已經(jīng)相當(dāng)于過去一年的總和，且2/3是女性。

更令人擔(dān)心的是，目前的疫情已經(jīng)不限于德國。據(jù)德國媒體報道，與德國北部接壤的丹麥已出現(xiàn)一例初步確診感染EHEC的病例和至少6例疑似病例。

不過，德國相關(guān)部門的反應(yīng)速度值得稱道。在不到半個月的時間里，衛(wèi)生部門宣稱找到了導(dǎo)致這次疫情的始作俑者。

5月24日，位于德國不倫瑞克的亥姆霍茲聯(lián)合會傳染病研究中心使用電子顯微鏡獲得了此次感染的EHEC的電鏡照片。而該國明斯特大學(xué)醫(yī)院26日則宣布，此次疫情是由被稱為“Husec41”的EHEC亞型變異引起的。

同樣是在26日，德國漢堡衛(wèi)生研究所宣布，在產(chǎn)自西班牙的生鮮黃瓜中檢測出了EHEC病菌，目前專家還無法排除其他食品攜帶這種病菌的可能性。

在德國北部，中國留學(xué)生秦濤(化名)則發(fā)現(xiàn)，他所在地區(qū)的超市已將**來自西班牙的黃瓜下架。

看來，EHEC以蔬菜為傳染媒介有跡可循。

從此前**衛(wèi)生組織(WHO)公布的研究資料來看，越來越多的EHEC暴發(fā)與食用水果和蔬菜(芽苗菜、生菜、涼拌卷心菜、色拉)有關(guān)，污染可能是由于種植或處理期間的某一階段接觸到了家畜或野生動物糞便所致。

中國疾控中心**科學(xué)家曾光向《科學(xué)時報》記者表示，中國疾控中心肯定在密切關(guān)注德國的疫情。但此外，他并未透露更多信息。

中國機構(gòu)出援手

“漢堡大學(xué)醫(yī)學(xué)院主動和華大基因研究院取得了聯(lián)系。”歐洲華大市場總監(jiān)韓新華說。

原來，漢堡大學(xué)醫(yī)學(xué)院計劃通過對該致病性大腸桿菌進行DNA測序，從而了解菌種的變異信息。鑒于歐洲華大的測序能力在歐洲已有了一定的知名度，他們在**時間尋求和中國伙伴的合作。

歐洲華大也作出**，不但會對這次發(fā)現(xiàn)的變種EHEC進行測序和基因組分析，而且不會收取任何費用。

 “我們將協(xié)助德國研究人員盡快找出致病原因、確定**方案，以便及時采取有效的措施，防止疫情進一步惡化。另外，也會為其在**篩選、新藥研發(fā)、后期預(yù)防等方面提供主要依據(jù)信息。”韓新華說。

記者了解到，此次漢堡大學(xué)醫(yī)學(xué)院委托的測序工作，將在中國深圳進行。在被問到什么時間可以公布結(jié)果時，韓新華稱華大基因有幾個不同級別的測序方案，但時間目前不好估計。

而一位不愿意透露姓名的專家告訴《科學(xué)時報》記者，大腸桿菌的基因組較小，測序在**左右即可完成，加上序列拼接和基因組分析，“時間可能在數(shù)天內(nèi)”。

EHEC的前生后世

作為大腸桿菌的一種，雖然EHEC可引起嚴重的食源性**，但大部分大腸桿菌是生存于人和溫血動物腸道內(nèi)的常見**，大多數(shù)菌株并無害。

EHEC屬于大腸埃希氏菌，所導(dǎo)致的感染可以產(chǎn)生輕度腹瀉、出血性腸炎(HC)、溶血性尿毒綜合征(HUS)、血栓性血小板減少性紫癜(TTP)等。此次的變種亞型可引起較嚴重的溶血性尿毒綜合征，并導(dǎo)致腎衰竭。

在此次疫情暴發(fā)之前，導(dǎo)致大規(guī)模疫病的EHEC多以O157：H7血清型菌株為主，它是一種能產(chǎn)生志賀**的大腸桿菌。

1996年，日本暴發(fā)EHEC疫情，造成9451人發(fā)病，似與學(xué)校午餐中食用污染的蘿卜纓有關(guān);2006年，美國也遭受過一次EHEC侵襲，造成1人死亡、14人腎臟損傷，至少94人因此住院**。

而這次，發(fā)生在德國的EHEC感染與以往都有不同。

據(jù)德國媒體報道，以往超過八成的EHEC病人都在18歲以下，而這次大部分患者是成年人，而且大部分是注重健康的女性。

韓新華告訴《科學(xué)時報》，歐洲華大的德方合作單位確認，***對此次的EHEC病原幾乎失效。

但中國疾控中心傳染病研究所所長徐建國卻有些不同意見。他告訴記者，EHEC對一些***耐藥很正常。但是不是幾乎**的***都失效，則需要經(jīng)過很嚴格的實驗調(diào)查。

事實上，對幾乎*****都耐藥的**以NDM-1為代表，但是目前它只在醫(yī)院中有較多感染，傳播能力并不強。

不管如何，這種疑似“超級**”會致嚴重的**后果。WHO認為，規(guī)范的衛(wèi)生習(xí)慣可預(yù)防很多食源性**病菌的傳播。

WHO建議，預(yù)防EHEC感染，關(guān)鍵要把食物“煮透”，至少使食物中心的溫度達到70℃。多位衛(wèi)生專家也表示，勤洗手和對生鮮蔬菜采取嚴格的衛(wèi)生措施，將有效預(yù)防EHEC的感染。