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詳細(xì)介紹溫度梯度PCR和降落PCR有什么不同
詳細(xì)介紹溫度梯度PCR和降落PCR有什么不同?
1.什么是溫度梯度PCR?溫度梯度PCR是指在退火溫度不太明確時(shí),為了找到**退火溫度,在一臺PCR儀上同時(shí)做多管PCR反應(yīng)。每一管放在儀器內(nèi)不同列或是不同行上,分別進(jìn)行PCR反應(yīng)。例如:在50℃-60℃可以分6管,分別為50,52,54,56,58,60度。在不同的管類進(jìn)行PCR反應(yīng)。PCR反應(yīng)后,經(jīng)過電泳檢測的比較,看看哪個(gè)溫度的****。總之是通過溫度梯度PCR反應(yīng),來進(jìn)行退火溫度的*化。
2.什么是降落PCR?降落PCR是在同一個(gè)PCR管內(nèi)進(jìn)行PCR反應(yīng),只是每個(gè)循環(huán)的溫度不同(如每個(gè)循環(huán)降1度)。一般兼并引物多采用這種方法。降落PCR(touchdown PCR),通過設(shè)計(jì)多循環(huán)反應(yīng)的程序,以使相連循環(huán)的退火溫度越來越低。由于開始時(shí)的退火溫度選擇為高于估計(jì)的Tm值,隨著循環(huán)的進(jìn)行,退火溫度逐漸降到Tm值,并*終低于這個(gè)水平,用于確保**個(gè)引物—模板雜交事件發(fā)生在*互補(bǔ)的反應(yīng)物之間,即那些產(chǎn)生目的擴(kuò)增產(chǎn)物的反應(yīng)物之間。盡管退火溫度*終會降到非特異雜交的Tm值,但此時(shí)目的擴(kuò)增產(chǎn)物已開始幾何擴(kuò)增,在剩下的循環(huán)中處于超過任何滯后(非特異)PCR產(chǎn)物的地位。由于目標(biāo)是在較早的循環(huán)中避免低Tm值配對,在TD—PCR中*好應(yīng)用熱啟動技術(shù)。設(shè)計(jì)時(shí),退火溫度的范圍應(yīng)跨越15℃左右,從高于估計(jì)Tm值至少幾度到低于它10℃。實(shí)驗(yàn)中如持續(xù)出現(xiàn)假象帶(雜帶),則是因?yàn)槠鹗纪嘶饻囟忍停蚰康臄U(kuò)增產(chǎn)物和非目的產(chǎn)物的Tm值相差無幾,或非目的擴(kuò)增物以更高的擴(kuò)增效率擴(kuò)增,可把退火溫度每降低1℃所需的循環(huán)數(shù)增加到3或4。
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